Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Length 900 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Chd1lQ9CXF7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1lQ9CXF7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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