Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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