Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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