Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sppl3Q9CUS9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms