Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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