Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms