Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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