Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms