Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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