Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms