Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac9Q99N13 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac9Q99N13 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms