Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms