Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc12a9Q99MR3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc12a9Q99MR3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms