Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TriobpQ99KW3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TriobpQ99KW3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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