Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TrabdQ99JY4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TrabdQ99JY4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TrabdQ99JY4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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