Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klhl22Q99JN2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms