Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pacsin3Q99JB8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms