Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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