Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Smim11aQ99J19 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim11aQ99J19 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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