Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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