Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf144aQ925F3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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