Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csmd1Q923L3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms