Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms