Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms