Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Setd3Q91WC0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms