Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps3Q91VB4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps3Q91VB4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms