Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul7Q8VE73 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms