Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rprd1aQ8VDS4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rprd1aQ8VDS4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rprd1aQ8VDS4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rprd1aQ8VDS4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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