Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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