Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BbxQ8VBW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms