Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms