Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vrk3Q8K3G5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vrk3Q8K3G5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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