Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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