Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo18Q8K2I9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Fbxo18Q8K2I9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms