Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms