Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek9Q8K1R7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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