Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rasgef1bQ8JZL7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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