Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms