Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms