Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ep400Q8CHI8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ep400Q8CHI8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms