Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms