Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms