Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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