Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp27Q8CEG8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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