Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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