Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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