Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrif1Q8CDD9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrif1Q8CDD9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms