Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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