Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm16223Q8CBM3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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