Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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